2)1504-1515
vingt-quatre ans, Magellan devient soldat et entre dans l'armée. En 1505, le 25 mars, la première flotte portugaise sous les ordres de l'amiral Francisco de Almeida appareille et quitte Lisbonne, en descendant le Tage, pour conquérir un nouvel empire. A cet instant, Magellan n'est qu'un soldat parmi 1500 autres, sans privilège, un "sobresalente".
Le contact avec la réalité La flotte était composée de vingt fiers vaisseaux, de lourds galions, composés chacun de plusieurs centaines d'hommes. On comptait également des charpentiers et des ouvriers de toutes sortes. L'objectif de la mission était simple : "détruire et raser toutes les villes de commerce musulmanes de l'Inde et de l'Afrique, édifier des forteresses sur chaque point d'appui et y laisser une garnison". (S. Sweig, Magellan, 1938). La flotte devait occuper toutes les issues et passages, garder tous les détroits, de Gibraltar à Singapour, fermer la mer Rouge, le golfe Persique et l'océan Indien au négoce étranger. Elle devait également anéantir la puissance maritime du sultan d'Egypte, des radjahs de l'Inde et de maintenir tous les ports sous un contrôle sévère pour qu'à partir de l'an 1505 tout navire ne battant pas pavillon portugais ne puisse plus transporter un seul grain d'épice. Cette situation va lui permettre d'apprendre énormément. On ne ménage pas un sobresalente. Le soldat reçoit des ordres et s'exécute. Magellan apprend ainsi à manier l'épée, le rôle du marin, celui du marchand, de l'astronome,... Il doit manier la pelle pour creuser des tranchées, aller transporter des marchandises au village, arriser (diminuer la surface) les voiles, monter la garde, obéir et commander.
La bataille de Cannanore
Après quelques escarmouches, plus que de véritables combats, Magellan fait sa première vraie confrontation avec le combat au cours de la bataille navale de Cannanore (auj. Kannur, côte sud-ouest de Malabar, à l'ouest de l'Inde), qui eut lieu le 15/16? mars 1506. Ce jour peut être considéré comme un tournant dans sa vie. On décida de s'allier, secrètement. C'est ce que firent le zamorin de Calicut, soutenu par le sultan d'Egypte, et peut-être aussi par Venise (et son or). On parle d'une bataille opposant deux cents navires (appartenant à la flotte du zamorin) contre onze portugais (18 contre 1, pour les parieurs). Le hasard fait parfois bien les choses, puisque Lodovicco Varthema, voyageur d'origine italienne et aventurier, eut vent des préparatifs de la bataille, et par solidarité chrétienne, put prévenir à temps les portugais. A leur approche, les Indiens trouvèrent une flotte portugaise prête et en ordre de combat.
La bataille fit de nombreuses victimes. On parla de quatre-vingts morts et deux cents blessés, (ce qui était alors énorme pour ces premières coloniales) dont Magellan.
Quelques combats supplémentaires
Pendant les années qui suivirent, d'autres batailles eurent lieu. L'homme passa quelques temps en Afrique, retourna aux Indes, fut souvent blessé, participa à d'autres batailles, comme celle de Malacca (défaite portugaise), et eut peu de récompenses. Cependant, il montre un trait de caractère particulièrement apprécié, son intrépide volonté, qu'il montra en sauvant un autre conquistador, le capitaine Francisco Serrao. Cet homme, à qui il sauva la vie, sera d'une influence considérable. Mais Magellan est un homme modeste et s'efface devant la gloire à laquelle il peut prétendre. On lui confiait des missions, et s'en acquittait, sans s'en vanter. Magellan était aussi très courageux. Au cours d'une de ses missions, il fut chargé d'un de ces transports d'épices, qui rentrent régulièrement avec la mousson. Mais, le navire fit naufrage, sur un écueil, le banc de Padua. Le capitaine, les officiers et les gentilshommes voulurent être les premiers à utiliser les baleinières. Une mutinerie menaça. Magellan se proposa alors de rester avec les marins, si les "capitanes y hidalgos" s'engageaient à revenir les chercher avec un autre vaisseau. En 1510, remarqué alors par le haut-commandement, il est nommé officier. Et prit le commandement de la flotte qui devait venger la sanglante défaite de Malacca. En juin 1512, il retourna au Portugal. En raison de son statut de noble, il eut une solde, ce qui était déjà plus que le rien qu'avait tous les soldats qui revenaient. Mais cette solde était misérable, en regard de ce qu'amoncellaient tous les courtisans de la Cour, restés bien en arrière, et profitant des efforts et du sang versés par ceux qui combattaient et défendaient les couleurs de la couronne portugaise. Magellan reprit du service comme officier subalterne en Afrique. Blessé au genou au Maroc en 1513, mais désireux de servir le roi Manoel le Fortuné (du latin fortuna qui veut dire chance), il retourne au combat. Mais, suite à de sombres médisances, il est accusé de vol et trafic. Il tombe alors en disgrâce. Et, il rentre au Portugal.